Este repositorio contiene los archivos utilizados en el Minicurso: La Estadística Detrás del Análisis Filogenético del evento:
https://www.redmexbiomate.org.mx
Las diapositivas Estadística_Filogenias1.pdf corresponden a la primera parte. Inician discutiendo el contexto y las herramientas a utilizar. Posteriormente, describen muy básicamente cómo funciona el BLAST para encontrar secuencias homólogas utilizando secuencias de amino ácidos.
Las diapositivas Estadística_Filogenias2.pdf corresponden a la segunda parte. Describen muy básicamente algunos métodos para construir un árbol filogenético.
El archivo PhylogeneticTrees.ipynb es un Jupyter Notebook que ilustra como realizar árboles filogenéticos del tipo UPGMA y NJ, y se puede correr desde un Google Colab
https://colab.research.google.com