流程可以分为两部分： 重复序列注释 + 基因结构注释

都有详细的注释，按照文件顺序运行即可 运行一遍或者看一遍之后，就知道有一些步骤是可以并行的

流程非本人原创。 主要来自以下几位师兄师姐师弟师妹,由本人"缝合"而成: https://doi.org/10.1038/s41467-023-41220-x; https://doi.org/10.1093/molbev/msab134; https://doi.org/10.1038/s41559-023-02275-7; https://github.com/gotouerina/Annotation (Paper under review); https://github.com/duan12345678/Sympatric-speciation (Paper under review);