CAR T

CAR T cell trogocytosis and cooperative killing regulate tumour antigen escape https://www.nature.com/articles/s41586-019-1054-1

Junsang Doh

설 연휴 동안 dendritic cell의 trogocytosis에 대한 논문을 마무리하고 있다. 세포를 통째로 삼키는 phagocytosis에 비해 세포의 일부를 뜯어먹는 trogocytosis는 워낙 국소적으로 빠르게 발생하므로 "작정하고 보지 않으면" 보이지 않는다. <아는 만큼 볼 수 있는> 현상인 셈. https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.1912252116 Trogocytosis는 CAR-T의 대가인 Sadelain 교수의 2019년 Nature 논문에서 CD19 CAR-T 실패의 원인 중 하나로 지목하면서 최근 많은 주목을 받는 현상이다. 이 논문에서는 CAR-T세포가 CAR에 붙는 항원인 CD19을 trogocytosis로 가져오고, 이렇게 암세포의 항원을 발현하게 된 hybrid CAR-T 세포는 다른 CAR-T 세포에 의하 살해당하게 된다(fratricide). https://www.nature.com/articles/s41586-019-1054-1 Trogocytosis에 의해 암세포의 껍질을 가져온 CAR-T 세포는 다른 CAR-T 세포의 공격 대상이 되는 반면, 암세포의 주요 생존 기전을 가져와 만든 hybrid CAR-T 세포는 고형암 CAR-T 개발의 새로운 가능성을 보여준다. 한국계 미국인으로 추정되는 최재혁 교수님 연구팀은 피부 T세포 림프종이 과발현하는 유전자를 CAR-T 세포에 이식하여 암세포와 같은 끈질긴 생명력을 가지는 CAR-T 세포를 만드는데 성공하여 Nature에 발표한다. <껍질을 취할 것인가, 알맹이를 취할 것인가>는 예전부터 중요한 문제였던 것 같다. https://www.nature.com/articles/s41586-024-07018-7 물론, 알맹이를 취하는 것이 항상 좋은 전략인 것은 아닌 듯 하다. 암세포를 무리하게 삼킨 대식세포가 암세포를 제대로 소화시키지 못하면서 암세포의 알맹이가 안에서 섞여서 형성되는 hybrid cell에 대한 논문이 최근 Nature Communications에 나왔다. "bite off more than one can chew"는 위험한 전략이다. 통으로 잘 못 삼키면 본인의 정체성 마저 잃게 된다. https://www.nature.com/articles/s41467-023-42303-5 CD19 CAR-T 세포치료제의 성공과 함께 뜨겁게 달아오르던 면역세포치료제 시장이 연이은 임상 실패에 이어 CAR-T 세포가 림프종이 될 가능성이 제기되면서 차갑게 식고 있다. 반면, 면역세포치료제 관련 기초 연구는 이제 시작인 느낌이다. 충분한 기초 연구 없이 진행된 임상 개발은 한계가 있을 수 밖에 없다는 사례가 될 것 같다.

Regulatory T cells in the face of the intestinal microbiota

Single-cell mapping of combinatorial target antigens for CAR switches using logic gates

Comparing T cell receptor repertoires using optimal transport https://github.com/matsengrp/transport

https://www.mdpi.com/2072-6694/13/23/6067?fbclid=IwAR08a1BZsJqBGYafVhxFzi1OhIWn5EQm-IQ450cgbklPtm2jzmkwPAhMUPY T Cell Engaging Immunotherapies, Highlighting Chimeric Antigen Receptor (CAR) T Cell Therapy

acute myeloid leukemia; cellular therapy; chimeric antigen receptor; immunotherapy; microenvironment. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7058784/

"major limitations of cell squeezing is its inability to be utilized for plasmid DNA-based transfection, which is a central process of genome editing. Plasmid DNA delivery is significantly challenging because it is required to pass through the cellular membrane first, survive the nuclease-rich cytosol environment, and then enter the nuclear envelope. Because of this complication, transfection using plasmid DNA has not yet been demonstrated for cell squeezing in the absence of an external electrical apparatus.(24) " https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34142817/

"Loss or down-regulation of CD19 on malignant B cells may occur via different mechanisms including splicing, missense mutation or lineage switch. An integrated and comprehensive analysis of transcriptomic and proteomic data in both malignant and normal cells is therefore needed to capture information lacking from indirect analyses of mRNA or limited protein expression assays (Haider and Pal, 2013). " https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29017060/

CD34+CD38− leukemic stem cell https://www.nature.com/articles/s41375-018-0326-3

https://www.nature.com/articles/s41375-020-0792-2

"TAMs that express folate receptor β (FRβ) possess an immunosuppressive M2-like profile." https://www.nature.com/articles/s41467-021-20893-2